Microbiologia virologia

L’Unità Operativa Complessa di Microbiologia e Virologia (UOC MV) è un laboratorio mono specialistico dedicato alla patologia infettiva. La struttura svolge attività di diagnostica clinica sia per i pazienti ricoverati, negli ospedali a gestione diretta ASL Roma 1, sia per i pazienti ambulatoriali.

Presupposti scientifici e missione
La Microbiologia clinica moderna deve garantire la diagnosi e favorire la prevenzione e la terapia delle malattie da agenti trasmissibili, attraverso attività di sostegno ai clinici responsabili dei trattamenti e ai programmi di sanità pubblica; deve assicurare la sorveglianza delle resistenze ai farmaci antimicrobici e deve promuoverne l’uso appropriato. Ciò comporta non soltanto un impegno nelle attività di laboratorio in senso stretto, ma anche un forte ruolo di consulenza ai clinici, la partecipazione alla sorveglianza delle infezioni legate all’assistenza (ICA) e dell’antimicrobico resistenza (AMR), una funzione proattiva ed educativa nei confronti della implementazione dell’appropriatezza diagnostica.
La Microbiologia Virologia richiede una formazione specialistica dedicata ed un approccio professionale peculiare e specifico.
I nuovi bisogni assistenziali, ai quali la Microbiologia Virologia è chiamata a rispondere, rinforzano l’importanza di una diagnosi eziologica rapida e accurata per instaurare una terapia corretta, contenendo indirettamente la morbilità e mortalità dei pazienti settici. Questo approccio concorre inoltre a ridurre la cosiddetta pressione selettiva, che è alla base dell’anti microbico resistenza.

Rete e bacino d’utenza
La UOC Microbiologia Virologia è situata presso l’ospedale Ospedale San Filippo Neri (SFN) ed è configurata come laboratorio specialistico pubblico, nell’ambito della rete ospedaliera regionale. UOC MV fa parte del Dipartimento dei Laboratori della ASL Roma 1.
UOC MV è coordinata in termini funzionali con la Patologia Clinica (UOC PC) dell’ospedale SFN (cosiddetto laboratorio LEC-S, HUB n.3 del DCA 238/2017 Regione Lazio) e con i relativi SPOKE, proponendosi all’utenza come Laboratorio Logico Unico (LLU).  Il bacino di utenza di UOC MV è rappresentato da quello della stessa ASL Roma 1 e comprende le reti di presidii e ambulatori ex AO S. Filippo Neri, ex ASL RME, ex ASL RMA (per una popolazione residente superiore al milione di abitanti). È attualmente in corso un’attività di centralizzazione anche della diagnostica di laboratorio della ASL Roma 4.
Il workload di UOC MV è attualmente superiore ai 400 mila esami anno (70% circa dei quali è svolto per l’utenza territoriale non ospedaliera).

Storia
UOC MV è nata nel 1997, come risposta all’esigenza di destinare stabilmente un gruppo di operatori alle aree specialistiche della virologia (molecolare e immuno-diagnostica) e della batteriologia clinica. La struttura si è poi modificata per affiancare le necessità dell’ex Azienda Ospedaliera San Filippo Neri e della relativa Commissione Infezioni Ospedaliere (CIO). Attualmente, UOC MV gestisce i fabbisogni diagnostici dei presidii S. Filippo Neri (trasformatosi da azienda a vocazione chirurgica a ospedale multi funzionale integrato con il territorio), S. Spirito in Sassia, Oftalmico, Nuovo Regina Margherita, Centro S. Anna, nonché di un’ampia rete territoriale, composta da circa 60 strutture richiedenti (ambulatori, Case della Salute, centri CAD, consultori, SERD, etc.)

Offerta
UOC MV è operativa nella fascia 8-20, dal lunedì al sabato, nonché nella fascia 8-14 della domenica e dei festivi. Garantisce inoltre una pronta disponibilità notturna e festiva per determinate prestazioni urgenti.
Per i pazienti esterni l’accesso alle prestazioni avviene tramite il CUP, senza prenotazione; il prelievo/consegna dei materiali biologici è effettuabile – come per qualunque altro tipo di analisi cliniche in uno dei molti ambulatori prelievi aziendali. Il ritiro dei referti, in formato digitale, è gestito dalla piattaforma regionale Lazio Escape www.salutelazio.it/scarica-il-tuo-referto .
UOC MV è un laboratorio dotato di elevati livelli d’informatizzazione. La richiesta d’indagini microbiologiche dai reparti è effettuata mediante interfaccia web (dotata di un filtro per la richiesta di esami duplicati o inappropriati). Lo stesso software web è utilizzabile anche per la visualizzazione e la stampa in reparto dei referti validati elettronicamente. Un sistema analogo gestisce i collegamenti con gli ambulatori prelievi esterni e il ritorno dei referti con firma digitale.

Operatività
Attualmente la maggior parte delle richieste e dei referti si muove nella via informatica.  Il sistema gestionale di laboratorio presiede all’intero processo lavorativo: accettazione, check-in dei campioni, pianificazione del lavoro, collegamento con le strumentazioni, refertazione, etc. La totalità dei campioni di sierologia infettivologica è lavorata direttamente su provetta primaria (prelevata al paziente); lo stesso accade per le emocolture, la virologia molecolare HBV, HCV, HIV, i test IGRA per TB.  La tecnologia barcode è utilizzata per tracciare la lavorazione dei campioni secondari e le piastre per colture. Il referto è prodotto al termine di un processo che prevede tre livelli di controllo (validazione tecnica, clinica; firma elettronica). L’automazione strumentale coinvolge molte linee del laboratorio: ricerca di anticorpi e antigeni, ricerca di DNA e RNA microbici e virali, colture e identificazioni microbiche, etc.

Qualità 
Il laboratorio persegue una politica di miglioramento della qualità, con particolare attenzione alle procedure di prelievo dei campioni biologici e alla lavorazione secondo linee guida e tecnologie accreditate. UOC MV esegue e registra con regolarità il controllo di qualità (QC) interno per sierologia, immunodiagnostica e biologia molecolare; aderisce ad un ampio pannello di QC di terza parte per la sierologia infettivologica; utilizza ceppi standard per il QC batteriologico; aderisce da molti anni - per un amplissimo ventaglio di linee al programma di controllo qualità esterno (VEQ) gestito dal “United Kingdom National External Quality Assesment Service”.
Tutto il personale presente nella UOC MV – medici, biologi e tecnici di laboratorio – dispone di una poliennale esperienza nel campo specifico della microbiologia virologia, acquisita in loco e presso altre, analoghe, strutture specialistiche. Lo stesso staff, inoltre, dal 2017 è coinvolto in un progetto strutturato e regolare di audit clinico-organizzativi, a valenza ECM, per il miglioramento continuo della qualità diagnostica.
Dal gennaio 2011 la UOC Microbiologia e Virologia esegue e referta gli antibiogrammi in accordo alle linee guida europee EUCAST (UOC MV è stato, di fatto, il primo laboratorio clinico regionale ad aderire allo standard europeo). In concomitanza con l’adozione delle regole EUCAST, allo scopo di migliorare le prescrizioni antibiotiche, il laboratorio si è anche dotato di un sistema informatico esperto. Il sistema controlla, in modo flessibile, la congruità dei risultati ma anche la “visibilità” degli antibiotici di maggiore impatto ecologico presenti nell’antibiogramma. Con questo progetto, il team della UOC MV intende rendere operative le indicazioni sull’uso prudente degli antibiotici.
La Microbiologia Virologia, come gli altri laboratori del dipartimento, è attualmente impegnata in un ampio progetto aziendale per pervenire all’accreditamento ISO 1589 di alcune linee di attività (cfr. progetto n.19 del Masterplan 2018-20, ASL Roma 1).

Attività esterne
Dal 2000, la UOC MV lavora in stretta collaborazione con le Direzioni Sanitarie (aziendali e di presidio) con le diverse Commissioni per il Controllo delle Infezioni correlate all’Assistenza (CCICA). Report periodici su epidemiologia di microrganismi e resistenze antibiotiche vengono prodotti per supportare interventi preventivi o regolare la terapia empirica. In laboratorio, è attivo un sistema giornaliero di allerta su microrganismi sentinella e sospetti episodi epidemici. Con l’avvento della ASL Roma 1, queste attività di sorveglianza di laboratorio di ICA sono state incardinate – come da indicazioni regionali - prima nel Piano Annuale del Risk Management (PARM), poi nel Piano Annuale Infezioni Correlate all’Assistenza (PAICA).
Nel 2003 la Microbiologia, insieme con altre strutture dell’ospedale SFN, è stata onorata dall’assegnazione del "premio Regionale all'eccellenza in Sanità per il sistema di sorveglianza attiva delle infezioni ospedaliere in area intensiva". Dal 2007, l’UOC MV ha aderito al progetto pilota nazionale di sorveglianza basata sui dati di laboratorio Micronet (CCM), poi confluito nel sistema di sorveglianza delle resistenze microbiche AR-ISS (Istituto Superiore di Sanità) ed EARS-Net (Centro Europeo di Controllo delle malattie infettive ECDC). 
Negli ultimi anni, la Microbiologia Virologia MV è stata impegnata nelle attività di sorveglianza e prevenzione AMR previste nel cosiddetto Progetto 7.3 del Piano Regionale della Prevenzione (PRP 2014-2019). UOC MV aderisce attualmente anche alle iniziative regionali previste nell’ambito del Piano Nazionale di Contrasto dell’Antimicrobico Resistenza (PNCAR 2017-2020).